La gouvernance de Transitions Pro est assurée par un conseil d’administration paritaire composé de représentations syndicales employés et employeurs. La Présidence de Transitions Pro Grand Est est actuellement pilotée par Michel KLEIN, représentant du MEDEF, et la vice-présidence par Marius GERMINAL, représentant de la CFDT.
Le réseau des 17 Transitions Pro est coordonné par Certif’Pro, l’association nationale pour la certification paritaire interprofessionnelle et l’évolution professionnelle.